脂肪肝的治療目標在於減少肝臟脂肪累積、阻擋疾病惡化為肝纖維化或肝硬化，並降低心血管疾病風險。目前尚無專一性藥物核准使用，因此治療焦點著重在控制代謝異常與改善肝臟代謝。醫師會根據患者是否合併糖尿病、肥胖或血脂異常等條件，制定個人化治療方案。
治療策略需結合醫學監測與生活型態調整，並定期追蹤肝臟功能與脂肪含量變化。嚴重病例可能需要評估侵入性治療，但絕大多數患者仍以非藥物干預為主要治療路線。跨領域醫療團隊（包括營養師、運動治療師）的參與能顯著提升治療成效。
目前治療分為直接針對肝臟脂肪的藥物療法，以及間接改善全身代謝異常的非藥物策略。藥物治療主要針對代謝症候群相關因素，而非直接溶解肝臟脂肪。非藥物治療則是核心基礎，尤其在初期階段能有效阻擋疾病惡化。
治療選擇需考量脂肪肝類型：酒精性脂肪肝需優先戒酒，而非酒精性脂肪肝（NAFLD）則需針對胰島素阻抗與代謝問題著手。嚴重纖維化患者可能需要評估肝臟組織活檢以評估治療成效，而藥物選擇需排除肝臟代謝異常的禁忌症。
目前食品藥物管理署核准的藥物仍有限，但以下藥物在臨床實務中被視為潛力選項：
實驗性藥物包括ACAT1抑制劑與FXR受體促效劑，這些新藥物能直接調節肝臟脂質代謝途徑。臨床試驗顯示FXR促效劑obeticholic acid可降低肝纖維化指數，但需監測膽鹽代謝異常的副作用。
侵入性治療目前僅用於極端案例：
替代療法需配合嚴謹評估，草本補充劑如奶蓟草的療效未經證實，可能與藥物產生交互作用。所有侵入性治療前必須評估患者全身代謝狀態與手術風險。
低碳水飲食（<50%熱量來源）能有效降低肝臟脂肪，地中海飲食模式因富含Omega-3脂肪酸與纖維質，被證實能改善非酒精性脂肪肝指數。需避免反式脂肪與精緻糖類，建議每日攝取15-20%熱量來自優質蛋白質（如魚類、豆類）。
每周150分鐘中強度有氧運動（如快走、游泳）結合阻力訓練，能有效減少肝臟脂肪含量。研究顯示結合間歇性斷食的運動計畫，可提升胰島素敏感度20%以上。運動強度需根據肝臟功能調整，嚴重肝硬化患者需避免過度耗能訓練。
控制體重至BMI<24是關鍵策略，減重7-10%已被證實能顯著改善肝臟脂肪沈積。合併糖尿病患者需將HbA1c控制在6.5%以下，高血脂患者需降低低密度脂蛋白至<100 mg/dL。戒酒對酒精性脂肪肝患者是第一線治療，需完全戒除酒精攝取。
基因治療與肝臟靶向藥物是當前研究熱點，利用納米粒子載體遞送siRNA以抑制肝臟脂肪合成途徑的技術正在臨床試驗階段。間質幹細胞移植試圖修復肝臟纖維化組織，但長期安全性仍待觀察。
人工智慧診斷系統能即時評估肝臟脂肪比例，結合穿戴式裝置追蹤代謝指標，未來可能形成個人化治療平台。基因定型分析將協助預測治療反應，例如PPARG基因多型性患者對特定藥物的反應較佳。
當出現不明原因疲勞、右上腹脹痛、黃疸時應立即就醫。肝功能檢查顯示AST/ALT比值>2、超音波顯示重度脂肪肝（S2-S3級別）時，需轉介消化科或肝膽科進一步評估。合併第三型高血脂或合並代謝症候群患者需每6個月追蹤肝臟超音波。
治療6-12個月後若肝臟脂肪含量未改善，或出現門脈高血壓症狀（如食道靜脈曲張），需由肝臟專科醫師評估治療方案。藥物治療期間需定期監測肝酵素與腎功能，特別是使用維生素E超過6個月者需留意脂溶性維生素代謝異常的風險。
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